Comme aux Antilles, il se compose de deux saisons bien distinctes : la saison sèche et la saison pluvieuse. Bien entendu, l'altitude joue un rôle non négligeable dans les variations climatiques : ainsi le Panama connaît de nombreux microclimats.

La côte caraïbe se distingue car elle est beaucoup plus pluvieuse en toutes saisons, tandis que la côte pacifique est plus sèche. La saison des pluies dures du mois de mai au mois de novembre. Une telle saison présente des avantages. Ainsi, de nombreux touristes aiment cette période de l'année en raison de l'importante floraison et de prix plus intéressants. À l'inverse de la saison sèche s'étend de décembre à avril. Tout comme aux Antilles, il a peu d'écarts de température au cours de l'année. Une fois de plus, c'est l'altitude qui aura le plus d'influence sur les températures.